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SLAF-seq技術(shù)在鑒別桉樹品種中的應(yīng)用

龐貞武; 劉鑫; 孫雪陽; 蘭俊; 陳德文 廣西國有東門林場; 廣西扶綏532108
  • 尾巨桉
  • 無性系
  • 分子鑒定

摘要:本文嘗試采用一種簡化基因組測序技術(shù)(SLAF-seq)對2個尾巨桉無性系品種進行分子鑒定。實驗共獲得32.69Mreads的測序數(shù)據(jù),測序質(zhì)量值分布檢查結(jié)果Q30為95.28%,堿基分布檢查結(jié)果GC含量為40.61%;通過生物信息學分析共開發(fā)SLAF標簽857589個。樣品間SNP多態(tài)性比較結(jié)果表明,A1與A2、A3的基因型一致SNP比例分別為35.81%、77.27%,達到區(qū)分不同無性系品種的實驗設(shè)計預期。

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桉樹科技

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主管單位:國家林業(yè)局桉樹研究開發(fā)中心;主辦單位:國家林業(yè)局桉樹研究開發(fā)中心

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