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茶樹SRO基因家族的鑒定及表達(dá)分析

郭永春; 王鵬杰; 陳笛; 鄭玉成; 陳雪津; 葉乃興 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院/茶學(xué)福建省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 福建福州350002
  • 茶樹
  • sro
  • 系統(tǒng)進(jìn)化
  • 干旱脅迫

摘要:SROs(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族。本研究利用生物信息學(xué)方法從茶樹基因組中鑒定獲得9個(gè)茶樹SRO基因家族成員,分別命名為CsRCD1-4和CsSRO1-5。9個(gè)茶樹SRO基因的編碼蛋白均具有特征結(jié)構(gòu)域PARP和RST,具有相似的保守基序。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析聚分為3組,Ι組包含CsRCD1-4,Ⅱ組包含CsSRO1和CsSRO2,Ⅲ組包含CsSRO3-5?;蚪Y(jié)構(gòu)分析表明每個(gè)CsSRO基因含有4至9個(gè)外顯子。8個(gè)茶樹組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析表明,CsRCD1、CsRCD3和CsRCD4可能在茶樹不同發(fā)育階段具有重要作用;大多數(shù)CsSRO基因在根和成熟葉中較高表達(dá)。上游啟動(dòng)子區(qū)域分析發(fā)現(xiàn)大量與植物發(fā)育、激素及脅迫響應(yīng)密切相關(guān)的順式作用元件,進(jìn)一步對(duì)CsSRO基因在干旱和脫落酸處理下的表達(dá)模式進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),9個(gè)CsSRO基因均被誘導(dǎo)表達(dá),CsSRO基因可能與茶樹抗旱密切相關(guān)。

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茶葉科學(xué)

  • 預(yù)計(jì)1-3個(gè)月 預(yù)計(jì)審稿周期
  • 1.53 影響因子
  • 農(nóng)業(yè) 快捷分類
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:中國(guó)科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì);主辦單位:中國(guó)茶葉學(xué)會(huì);中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所

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