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草莓FvARF5基因的克隆、生物信息學(xué)及表達(dá)分析

蘇麗艷 西安文理學(xué)院生物與環(huán)境工程學(xué)院秦嶺野生觀賞植物研究中心; 陜西西安710065
  • 草莓
  • fvarf5
  • 生長素
  • 基因克隆

摘要:生長素響應(yīng)因子ARF是一類新的轉(zhuǎn)錄因子,通過激活或抑制生長素響應(yīng)基因的表達(dá)調(diào)控植物的生長發(fā)育過程。為解析草莓生長素響應(yīng)因子FvARF5在草莓形成過程中的功能,以草莓為試驗(yàn)材料,克隆了FvARF5基因并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,利用qPCR分析了FvARF5在草莓不同組織及植物激素處理下的表達(dá)模式。結(jié)果表明,FvARF5基因開放閱讀框?yàn)?745bp,編碼914個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為100.65ku,等電點(diǎn)為5.25。多序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,FvARF5基因具有保守的B3DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和生長素響應(yīng)因子保守結(jié)構(gòu)域,與薔薇科月季ARF5基因的進(jìn)化關(guān)系最近,相似度達(dá)95%。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析表明,FvARF5蛋白定位于細(xì)胞核中。啟動(dòng)子分析顯示,FvARF5基因具有多樣化的激素應(yīng)答元件。qPCR結(jié)果表明,FvARF5存在組織表達(dá)差異,在莖和綠果中表達(dá)量較高。另外,FvARF5基因表達(dá)受到生長素和赤霉素的誘導(dǎo),初步推測(cè)該基因可能參與了生長素和赤霉素調(diào)控草莓果實(shí)的形成過程。為進(jìn)一步研究FvARF5基因的功能奠定基礎(chǔ)。

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