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中間錦雞兒CiATAF1基因的亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析

王燕飛; 紅格日其其格; 王光霞; 王瑞剛; 李國(guó)婧 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 內(nèi)蒙古呼和浩特010018; 內(nèi)蒙古植物逆境生理與分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 內(nèi)蒙古呼和浩特010018; 內(nèi)蒙古抗逆植物遺傳資源利用與分子改良科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì); 內(nèi)蒙古呼和浩特010018
  • 中間錦雞兒
  • ciataf1
  • 基因表達(dá)
  • 亞細(xì)胞定位
  • 非生物脅迫

摘要:為研究NAC轉(zhuǎn)錄因子在非生物脅迫條件下的表達(dá),以中間錦雞兒為材料,克隆并分析了NAC轉(zhuǎn)錄因子家族CiATAF1基因。該基因ORF全長(zhǎng)為873bp,編碼291個(gè)氨基酸,由2個(gè)內(nèi)含子和3個(gè)外顯子構(gòu)成,具有典型NAC結(jié)構(gòu)域。染色體步移法獲得CiATAF1基因啟動(dòng)子826bp,該啟動(dòng)子含有光、激素、厭氧誘導(dǎo)等多種響應(yīng)元件。經(jīng)擬南芥葉片原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)分析亞細(xì)胞定位,CiATAF1基因主要定位于細(xì)胞核中。熒光定量分析表明:CiATAF1基因表達(dá)具有組織特異性,相比于中間錦雞兒根和莖,在葉部表達(dá)量最高;在干旱、鹽、冷、ABA處理下,CiATAF1基因表達(dá)量增加,推測(cè)該基因可能與非生物脅迫應(yīng)答相關(guān)。CiATAF1同模式植物擬南芥及豆科其他植物的同源基因做多重序列分析,序列一致性為81.14%,表明ATAF1基因序列結(jié)構(gòu)相對(duì)保守。生物信息學(xué)分析CiATAF1蛋白質(zhì)屬于不穩(wěn)定的親水蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋、β折疊、無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成。研究結(jié)果對(duì)挖掘中間錦雞兒抗非生物脅迫的基因和深入分析逆境脅迫機(jī)理具有重要意義。

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