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適合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的芒果不同組織RNA試劑盒提取方法研究

張宇; 黃國(guó)弟; 莫永龍; 龍凌云; 張繼; 唐玉娟 廣西壯族自治區(qū)亞熱帶作物研究所; 廣西南寧530001
  • 芒果
  • rna
  • 試劑盒
  • 測(cè)序

摘要:為了探尋能夠滿足芒果各組織轉(zhuǎn)錄組測(cè)序要求的高質(zhì)量RNA提取方法,以‘桂熱芒82號(hào)’的葉片、花和果實(shí)為材料,從RNA提取質(zhì)量和產(chǎn)率、瓊脂糖電泳和RT-PCR結(jié)果分析、RNA測(cè)序質(zhì)量評(píng)價(jià)這3個(gè)方面,對(duì)常用的3種試劑盒的提取效果進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)研究和評(píng)價(jià)分析。結(jié)果表明:以來(lái)自于天根生化科技有限公司的DP419試劑盒提取的芒果各組織的RNA質(zhì)量均較好,提取的RNA產(chǎn)率遠(yuǎn)高于其余兩種試劑盒的提取產(chǎn)率;除以美伯生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司的RM103試劑盒提取芒果各組織所得RNA,經(jīng)瓊脂糖電泳未見(jiàn)有5S條帶出現(xiàn)外,以其余兩種試劑盒提取的芒果各組織的RNA都存在28S、18S、5S條帶且RT-PCR分析結(jié)果理想;對(duì)以3種試劑盒提取所得的RNA進(jìn)行完全測(cè)序,結(jié)果表明,3種試劑盒提取的RNA完全測(cè)序都大于98.99%,能滿足RNA-Seq分析的要求。文中綜合上述評(píng)判因素分析認(rèn)為,天根生化科技有限公司的DP419試劑盒是適用于芒果葉片、花和果實(shí)RNA提取的最優(yōu)試劑盒。

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經(jīng)濟(jì)林研究

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