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桂花SVP同源基因的克隆及序列分析

何國慶; 常鵬杰; 卞賽男 浙江省長興縣永綠林業(yè)發(fā)展中心; 浙江長興313100; 浙江農(nóng)林大學(xué)風(fēng)景園林與建筑學(xué)院; 浙江臨安311300
  • 桂花
  • svp
  • 基因克隆
  • 序列分析

摘要:試驗(yàn)以桂花‘日香桂'Osmanthus fragrans cv.rixianggui嫩葉為試驗(yàn)材料,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中SVP基因的保守序列信息,通過PCR方法克隆得到日香桂SVP基因,將其命名為QfSVP,運(yùn)用在線生物信息學(xué)分析工具對(duì)OfSVP序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明:OfSVP基因全長1325bp,開放閱讀框(ORF)為687bp,編碼228個(gè)氨基酸。氨基酸序列保守性分析發(fā)現(xiàn),OfSVP所編碼的蛋白中含有MADS-box基因家族特有的K-box區(qū)域。通過ProtParam ExPASy在線軟件分析OfSVP蛋白質(zhì)分子式為C1121H1859N327O364S9,分子量為26030.60Da,理論等電點(diǎn)PI值為5.80。不穩(wěn)定指數(shù)為68.10,屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。蛋白氨基酸序列比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析結(jié)果表明OfSVP與油橄欖(Olea europaea)、黃連(Coptis chinensis)和芝麻(Sesamum indicum)的同源性分別達(dá)到94%、83%和82%;OfSVP基因的克隆與序列分析對(duì)于進(jìn)一步了解桂花'日香桂'成花機(jī)理具有重要意義。

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