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可變剪接與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性

李敏 劉國(guó)慶 蔡祿 內(nèi)蒙古科技大學(xué)數(shù)理與生物工程學(xué)院 內(nèi)蒙古包頭014010 內(nèi)蒙古科技大學(xué)生物工程與技術(shù)研究所 內(nèi)蒙古包頭014010
  • 可變剪接
  • 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
  • 蛋白質(zhì)穩(wěn)定性
  • 疏水非均一性

摘要:研究可變剪接和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性之間的相關(guān)性,對(duì)于理解可變剪接的功能具有重要意義。已有研究支持可變剪接增加蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的觀點(diǎn),但可變剪接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的程度、機(jī)制等還尚未闡明。作者基于具有確定三維結(jié)構(gòu)的可變剪接蛋白質(zhì)變體數(shù)據(jù),從蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)差異和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性?xún)蓚€(gè)方面對(duì)致病和非致病的可變剪接蛋白質(zhì)變體對(duì)進(jìn)行了比較分析;通過(guò)建立實(shí)際可變剪接變體集和隨機(jī)可變剪接變體集,并定義蛋白質(zhì)的多樣性增量(increment of diversity,ID)和疏水非均一性(hydrophobic non-uniformity,HI),研究了可變剪接發(fā)生的非隨機(jī)性。結(jié)果表明:現(xiàn)有的多數(shù)可變剪接事件與隨機(jī)剪接相比,傾向于增加蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性;產(chǎn)生結(jié)構(gòu)差異較大蛋白質(zhì)的可變剪接事件傾向于導(dǎo)致疾病的發(fā)生。作者還提出了正負(fù)選擇壓力的動(dòng)態(tài)平衡假說(shuō)解釋這一現(xiàn)象,認(rèn)為與生命活動(dòng)相聯(lián)系的正選擇壓力促使增加蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的可變剪接事件在群體中固定,但反向的負(fù)選擇壓力約束著可變剪接改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的尺度,細(xì)胞中現(xiàn)有的可變剪接正是這兩種正負(fù)選擇壓力之間保持動(dòng)態(tài)平衡的結(jié)果。

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