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基于聚類分析的肺癌與基因相關(guān)關(guān)系研究

任雪菁; 安新穎; 范少萍 北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院/中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所; 北京100020
  • 肺癌
  • 基因
  • 文本挖掘
  • 數(shù)據(jù)挖掘
  • 聚類分析

摘要:目的:研究與不同類型肺癌存在關(guān)聯(lián)的基因及其與肺癌的關(guān)聯(lián),為肺癌相關(guān)基因領(lǐng)域的研究學(xué)者提供參考。方法:通過對(duì)肺癌、基因進(jìn)行命名實(shí)體識(shí)別、實(shí)體數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化處理、肺癌-基因矩陣構(gòu)建、肺癌-基因矩陣的聚類分析、文獻(xiàn)回溯等,基于聚類的方法發(fā)現(xiàn)不同類型肺癌存在關(guān)聯(lián)的基因及其在肺癌不同階段的具體關(guān)聯(lián)。結(jié)果:利用聚類分析的方法將肺癌大致分為A549 lung cancer,Advanced non-small-cell lung cancer,small cell lung carcinoma四大類。高頻基因主要是EGFR(在晚期非小細(xì)胞肺癌患者體內(nèi)突變率較高)、P53(主要在NSCLC晩期患者中高水平突變表達(dá))、KRAS(主要與NSCLC有關(guān))。結(jié)論:基因、蛋白質(zhì)、化學(xué)物質(zhì)等實(shí)體對(duì)肺癌的產(chǎn)生與治療至關(guān)重要。深入探究肺癌與基因的關(guān)系對(duì)肺癌的預(yù)防、診斷、治療均有重要意義。

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