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免疫沉淀——質(zhì)譜聯(lián)用揭示RCC2在乳腺癌MDA-MB-468細胞系中的新功能

陳震; 陳恒星; 胡開順 中山大學(xué)孫逸仙紀念醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究中心; 廣州510120
  • rcc2
  • 乳腺癌
  • 蛋白翻譯

摘要:目的分析RCC2蛋白在乳腺癌MDA-MB-468細胞系中的互作蛋白組并揭示其功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法運用酶切技術(shù)結(jié)合一代測序構(gòu)建攜帶Flag標簽RCC2蛋白過表達載體,慢病毒包裝感染構(gòu)建Flag-RCC2過表達的MDA-MB-468穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞株。采用Flag抗體凝膠珠親和沉淀,收集蛋白樣品進行高敏感度質(zhì)譜鑒定。生物信息蛋白組學(xué)分析互作蛋白組,包括GO注釋,KEGG通路富集,構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPIN)。結(jié)果高可信度164個蛋白聚類分析顯示,RCC2及其互作蛋白顯著富于核糖體相關(guān)通路中,具有RNA與核蛋白體結(jié)合能力,揭示其參與蛋白翻譯與成熟的過程。結(jié)論成功鑒定RCC2互作蛋白組,揭示RCC2在乳腺癌細胞中發(fā)揮新的翻譯調(diào)控功能。

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腫瘤防治研究

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